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gtf から転写物配列取得 "gffread"

この記事では、gtf を使って、リファレンス配列から転写物の配列を切り出す方法を紹介します。 gffread は cufflinks の昨日のうちの一つで、 gtf <-> gff の変換もできます。 以下の記事を参考に実際に gffread を使って転写物の配列を切り出します。 gffre…

遺伝子アノテーションファイル(GTFファイル)から特定の遺伝子を抽出

GTFファイルのうち特定の(調べたい)遺伝子だけを使いたいとき、 grepコマンドを用いて、その遺伝子を含む行を抽出する方法。 orebibou.com